Sarkosyl(N-月桂酰肌氨酸钠)是一种温和的阴离子去污剂,CAS号为137-16-6。10% Sarkosyl溶液的经典制备方法为:取10 g N-月桂酰肌氨酸钠溶解于去离子水中,定容至100 ml。在RNA实验中,为保证无RNase污染,制备过程需采取额外的去RNase处理措施。一种文献报道的方法为:在10g Sarkosyl溶于dH₂O并定容至100 ml后,加入0.2 ml焦碳酸二乙酯(DEPC),搅拌约2小时,再进行高压灭菌处理。此外,在含Sarkosyl的缓冲液配制中,应使用DNase-和RNase-free水。该类产品被加入裂解液中,用于抑制RNA提取过程中RNase对RNA的降解。
一、Sarkosyl在RNA提取中的作用机制
1.1 作为去污剂溶解细胞并抑制RNase
RNA提取的核心挑战在于RNase的普遍存在与稳定性。异硫氰酸胍(GTC)是最有效的蛋白质变性剂之一,作为强效RNase抑制剂被广泛应用于RNA提取。Sarkosyl在其中发挥协同作用:作为阴离子去污剂,它能够溶解细胞膜和核膜,促进蛋白质变性,与异硫氰酸胍共同作用以完全变性样本中存在的任何核糖核酸酶。
1.2 在AGPC单步法中的核心地位
Chomczynski与Sacchi于1987年建立的酸异硫氰酸胍-酚-氯仿(AGPC)单步法,已成为RNA提取的经典方法。该方法的核心试剂为变性溶液(溶液D),其组成为:4 M异硫氰酸胍、25 mM柠檬酸钠(pH 7.0)、0.5%(w/v)N-月桂酰肌氨酸(Sarkosyl)以及0.1 M 2-巯基乙醇。
在该方法的实际配制中,10% Sarkosyl溶液被用作储备液。具体配法为:将250 g异硫氰酸胍与293 ml水、17.6 ml 0.75 M柠檬酸钠(pH 7.0)以及26.4 ml 10% Sarkosyl在65 ℃下溶解,制成储备液。该储备液在室温下可保存至少3个月。在使用时,每50 ml储备液加入0.36 ml 2-巯基乙醇,即得到工作用变性溶液D。
1.3 溶液D的准备(无RNase的Sarkosyl溶液, 10%溶液)
该单步法可在4小时内完成RNA分离,产率和纯度良好,特别适用于大量样本处理以及微量细胞或组织样本的RNA提取。在酸性条件下,总RNA保留在上层水相中,而大部分DNA和蛋白质保留在界面或下层有机相中;随后通过异丙醇沉淀回收总RNA。
二、Sarkosyl在其他RNA/DNA研究中的应用
2.1 在RNA病毒研究中的应用
早在1975年,Leis等人即在Rous肉瘤病毒的研究中使用了10% Sarkosyl:将0.01 ml 10% Sarkosyl加入10×SSC处理的冷却溶液中并稀释至4 ml,随后进行Cs₂SO₄梯度离心以分离RNA-DNA共价杂交体。
2.2 在细菌基因表达研究中的应用
Robbins等人(1987)在化脓性链球菌M蛋白基因调控研究中,将原生质体悬浮于含0.05% Sarkosyl的4 M异硫氰酸胍溶液中(含0.1 M β-巯基乙醇和25 mM柠檬酸钠),以实现RNA的裂解与保护。
2.3 在染色质研究中的应用
在DNA双链断裂修复与染色质三维结构研究中,透析缓冲液含0.2% Sarkosyl,其配制采用EDTA、Tris-HCl(pH 8.1)和20% Sarkosyl储备液,并使用DNase-和RNase-free水定容。
2.4 在蛋白质溶解与纯化中的应用
值得注意的是,无RNase Sarkosyl溶液在蛋白质研究中同样具有重要作用。文献报道,10% Sarkosyl可提取超过95%的包涵体蛋白;相比SDS,Sarkosyl是更温和的去污剂,能保持蛋白质的天然折叠状态。其应用场景包括His₆标签蛋白的Ni²⁺树脂纯化、GST标签蛋白纯化(需结合Triton X-100和CHAPS)、膜蛋白提取及后续分析等。
三、与其他去污剂的比较
与SDS(十二烷基硫酸钠)相比,Sarkosyl作为一种更温和的去污剂,在蛋白质变性方面作用较为温和,有利于保持目标蛋白质的活性。在RNA提取中,Sarkosyl与SDS均可用作去污剂组分,例如10%无RNase的SDS溶液也被报道作为Northern blot和Southern blot杂交及洗涤缓冲液的组分,可用于SDS-PAGE、细菌碱裂解等实验。
无RNase的10% Sarkosyl溶液是现代分子生物学实验中不可或缺的试剂。作为异硫氰酸胍-酚-氯仿单步法裂解液(溶液D)的关键组分,它与异硫氰酸胍协同作用,通过强变性效应抑制RNase活性并促进细胞裂解,从而实现完整、未降解RNA的高产量提取。其应用范围已从经典的RNA提取扩展到染色质结构研究、病毒RNA研究以及蛋白质溶解与纯化等多个领域。
随着RNA相关研究(如转录组学、表观遗传学)的持续深入,对无RNase级试剂的需求将不断提升。商品化的即用型10%无RNase Sarkosyl溶液以其便捷性和质量稳定性,正逐步成为实验室标准化配置的选择。
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