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发布日期:2026/7/20 17:09:00

肠道微生物群与人类健康密切相关,但大量肠道共生菌为严格厌氧菌,对培养条件和营养需求十分苛刻。传统的富集培养基如GAM(Gifu Anaerobic Medium)虽已广泛应用,但YCFA培养基凭借其模拟肠道化学环境的成分设计,在基于培养组学(culturomics)的高通量菌株分离中展现出独特优势。YCFA培养基全称为"Yeast Casitone Fatty Acids Medium",最初由日本微生物菌种保藏中心(JCM)以JCM Medium 1130编号收录,后被德国DSMZ收录为DSMZ Medium 1611(modified YCFA),并被全球多个实验室和商业供应商广泛采用。

一. YCFA培养基的成分与配方原理

1.1 核心营养成分

YCFA培养基的核心营养成分因版本不同而略有差异,但总体均以模拟肠道环境为目标。在蛋白质和碳源方面,基础配方、全配方和改良配方(DSMZ 1611)均包含酪蛋白胨(Casitone/Amicase)10.0 g/L和酵母提取物2.5 g/L;基础配方不含糖类,而全配方添加了葡萄糖2.0–5.0 g/L、麦芽糖2.0 g/L和纤维二糖2.0 g/L,改良配方仅添加葡萄糖5.0 g/L。在无机盐和缓冲体系方面,三者均含碳酸氢钠4.0 g/L、K₂HPO₄ 0.45 g/L、KH₂PO₄ 0.45 g/L、NaCl 0.9 g/L和CaCl₂·2H₂O 0.09 g/L;MgSO₄·7H₂O含量稍有差异,基础配方为0.044–0.09 g/L,全配方为0.09 g/L,改良配方为0.045 g/L;此外,全配方还额外添加了(NH₄)₂SO₄ 0.9 g/L。在还原剂与指示剂方面,基础配方不含L-半胱氨酸盐酸盐,全配方和改良配方分别添加0.5–1.0 g/L和0.5 g/L;三者均添加刃天青0.001 g/L作为氧化还原指示剂。

1.2 各组分的功能

  • 酪蛋白胨/Amicase:提供氨基酸、肽类氮源及生长因子,是主要的氮源供给物。
  • 酵母提取物:提供B族维生素和多种辅助生长因子,促进苛求微生物的生长。
  • 葡萄糖、麦芽糖、纤维二糖:作为可发酵碳源,支持多种厌氧菌的能量代谢。
  • 碳酸氢钠:与磷酸盐缓冲体系(K₂HPO₄/KH₂PO₄)共同维持pH 6.7-7.4的稳定范围,适应肠道菌群的生长需求。
  • L-半胱氨酸盐酸盐:作为还原剂,帮助建立和维持厌氧环境。
  • 刃天青(Resazurin):氧化还原指示剂,在氧化状态下呈红色,还原状态下无色,用于监测培养基中的氧含量。
  • Mg²⁺、Ca²⁺:提供必需金属离子,参与酶的活性中心和细胞壁稳定性。

1.3 补充添加物(全配方)

全配方YCFA培养基还需添加以下关键成分:

  • 挥发性脂肪酸溶液(Volatile Fatty Acids, VFA):包含乙酸、丙酸、异丁酸、丁酸、异戊酸、戊酸等短链脂肪酸,模拟肠道中的脂肪酸环境,对某些严格厌氧菌(如拟杆菌门、梭菌纲)的生长至关重要。
  • 维生素溶液(Wolin氏维生素):包含生物素(1 μg/L)、钴胺素(1 μg/L)、对氨基苯甲酸(3 μg/L)、叶酸(5 μg/L)、吡哆胺(15 μg/L)等微量营养素,满足厌氧菌的维生素需求。
  • 氯化血红素(Hemin):提供血红素,是拟杆菌门等菌种的重要生长因子。

1.4 配方变体

  • 基础YCFA(不含维生素和脂肪酸):适用于用户自行配制补充成分,干粉形式,使用时称取约18.44 g/L,可灵活添加碳源、维生素等。
  • 全配方YCFA:含所有维生素、脂肪酸和血红素,即开即用型,适用于高通量培养组学研究。
  • 改良YCFA(DSMZ 1611):DSMZ标准化的改良版本,推荐用于厌氧菌培养,保质期较短(2-8°C保存,有效期一个月)。
  • YCFA血平板:加入无菌脱纤维羊血或马血,用于分离苛求病原菌。

二. YCFA培养基的制备方法

2.1 标准制备流程(基于DSMZ 1611)

溶解基础成分:将酪胨、酵母浸粉、葡萄糖、MgSO₄·7H₂O、CaCl₂·2H₂O、K₂HPO₄、KH₂PO₄、NaCl、刃天青溶解于去离子水中。

煮沸与驱氧:加入挥发性脂肪酸溶液(10 mL/L),加热煮沸10分钟,冷却至室温。

通入CO₂:向冷却后的培养基中通入100% CO₂气体驱氧。

添加还原剂和NaHCO₃:加入L-半胱氨酸盐酸盐、NaHCO₃和氯化血红素。

调节pH:使用KOH或HCl将pH调至6.7-6.8

分装与灭菌:在CO₂气流保护下,将培养基分装至Hungate厌氧管(10 mL/管),121°C高压灭菌15分钟。

加入维生素:冷却后,无菌条件下向每管加入100 μL过滤除菌的维生素溶液。

数据来源:

2.2 基础干粉制备法(不含维生素和脂肪酸)

称取18.44 g干粉培养基,加入1000 mL蒸馏水,加热溶解。

121°C高压灭菌15分钟。

冷却至55°C倾倒平板或分装液体。

根据实验需要,在灭菌前或灭菌后添加糖类、血红素、维生素和脂肪酸溶液。

2.3 全配方制备与注意事项

全配方YCFA制备时需注意:

配制过程中会产生大量泡沫,属正常现象,数分钟后可自行消失。

建议在通风橱中操作,避免吸入粉尘和挥发性脂肪酸气体。

分装时应保证培养结束后培养基的氧化层不超过高度的50%,接种前氧化层应小于高度的20%。

干粉未开封保质期三年,开封后需密封防潮。配制的液体培养基在2-8°C储存,有效期一个月。

三. YCFA培养基的质量控制

3.1 物理指标

  • 外观:粉末状均一,无结块;液体培养基应澄清或带刃天青的淡粉/无色。
  • pH:基础配方pH 6.7-6.8;全配方pH 7.4-7.5。
  • 颜色指示:含刃天青的培养基在接触氧气时呈红色,厌氧条件下无色。

3.2 微生物质控

标准质控菌株包括:

  • 大肠埃希氏菌(Escherichia coli):在YCFA上良好生长。
  • 产气荚膜梭菌(Clostridium perfringens):厌氧条件下生长良好,可用于验证厌氧条件。

质控培养条件:36°C需氧或厌氧培养48小时。

四. YCFA培养基在肠道微生物研究中的应用

4.1 微生物培养组学(Culturomics)

YCFA培养基已被广泛应用于人类肠道微生物的培养组学研究。Lagier等人在2016年的综述《State of the Art in the Culture of the Human Microbiota》中,将YCFA列为高通量分离肠道菌群的关键培养基之一,指出其能够支持较高丰度和多样性的肠道厌氧菌生长。

4.2 结直肠癌患者肠道菌群分离

Huang等人(2023)在研究结直肠癌患者粪便中致病共生菌的分离时,使用了YCFA平板在37°C厌氧条件下培养72小时,并指出"YCFA平板能够培养多种人类肠道微生物"。研究者根据菌落大小、颜色和形态挑选单菌落,在YCFA液体培养基中进行纯培养后鉴定。

4.3 野生动物肠道微生物研究

Pereira等人(2020)在埃及獴(Herpestes ichneumon)肠道微生物组学研究中,使用YCFA培养基在厌氧条件下获得了5.5×10⁹ CFU/g的厌氧菌平均回收率,与人类粪便微生物的报道结果一致。该研究证明YCFA可适用于哺乳动物肠道菌群的广谱培养。

4.4 厌氧单细胞分选与培养

Afrizal等人(2022)在厌氧单细胞分选(Anaerobic Single-Cell Dispensing)研究中,使用YCFA培养基作为人肠道厌氧菌培养的基础基质。该研究利用FACS结合YCFA培养实现了高分辨率、高通量的厌氧菌分离。

随着人类微生物组计划的深入和"可培养微生物组"概念的兴起,YCFA培养基将在以下方向持续发挥重要作用:消化道疾病菌群标志物的分离与功能验证、新型益生菌菌株的挖掘、粪便菌群移植(FMT)供体筛选及菌群库构建、以及厌氧菌活菌制剂的工业化生产。

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